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洗涤室用于玻璃器皿、实验用具的清洗、干燥、培养材料清洗、预处理也可在本室完成,面积一般在40-60平米。室内应建造大型水槽和一个或几个浸泡池,水槽最好上一内衬白瓷片的水泥槽,为防止碰坏玻璃器皿,下面可铺一活动的橡胶板。备有晾瓶架,用于放置刷净的培养器皿,配备有一定数量的周转盘或小推车,用于运输培养器皿。地面要注意防滑,排水通畅,墙壁要有耐湿、防潮功能。